Ствол является наиболее древней частью головного мозга, но он не является нашим самым древним мозгом. Наиболее древним мозгом является органный мозг. Ядро каждой клетки, по сути, является частью органного мозга, наблюдаемого и по сей день в растениях.

Головной мозг — это удивительное создание природы. Первоначально он обслуживал, наподобие компьютера, кишечник и первичные оболочки (дерму, брюшину, плевру и перикард). Все функции первоначально осуществлялись через органный мозг. Со временем последующими задачами головного мозга стала координация более развитых социальных функций.

Наиболее древней частью головного мозга, аналогичной органному мозгу, является ствол. Ствол контролирует весь желудочно-кишечный тракт (за исключением эктодермальных частей, мигрировавших позднее) и все его производные, например, легкие, печень, поджелудочную железу, матку, простату, собирательные трубочки почек или слюнные железы ротовой полости.

Расположение реле ствола мозга в точности повторяет порядок этих органов в теле. Черепно-мозговые нервы обеспечивают иннервацию желудочно-кишечного тракта, включая исходную кольцевидную кишечную трубку (современный рот), поскольку правая сторона контролирует поступление и транспортировку пищевого куска, а левая — выведение фекалий из кишечной трубки (см. «Таблицу ГНМ 12+1 черепно-мозговых нервов» (Немецкое издание, 2004).

Относительно гладкой мускулатуры кишечника и ее производных см. средний мозг (верхняя часть ствола мозга).